В коллекции музея ИППО представлены уникальные документы, фотографии и предметы, связанные с историей российского присутствия в Святой Земле, становлением, развитием и деятельностью Императорского Православного Палестинского Общества.
Среди них можно увидеть документы и фотографии, относящиеся к созданию Общества, всеподданнейшие доклады первых Председателей Палестинского Общества Великого князя Сергия Александровича и Великой княгини Елизаветы Федоровны Императору Николаю II о результатах трудов Общества, фотографии русских паломников, храмов, подворий и объектов ИППО на Святой Земле.
В музее хранятся документы и фотографии, посвященные археологическим раскопкам на Русском месте близ храма Гроба Господня (1883) в Иерусалиме; материалы научных экспедиций Н. П. Кондакова по Сирии и Заиорданью (1891), путешествия Ф. И. Успенского в Пальмиру и Баальбек (1898), командировки А. А. Цагарели на Синай, Афон и в Иерусалим для изучения грузинских древностей (1882), А.В. Елисеева – для исследования древнего пути в Святую землю через Кавказ и Малую Азию (1886).
__________________галерея__________________
Издавна в Святой Земле изготавливались различные памятные церковные реликвии для паломников: нательные кресты, иконы и образки. Многие изделия создавались из перламутра – традиционного материала палестинских резчиков. Ближе к XX в. стали особо популярны камни из реки Иордан с изображением Крещения Господня, иконы, написанные на лобной части рыб из Галилейского моря, крестики и иконы, изготовленные из оливкового дерева с горы Елеон, с горы Фавор, из кипариса или дуба из других святых мест. В музее ИППО представлена коллекция паломнических реликвий из личного собрания действительного члена ИППО, известного искусствоведа С. В. Гнутовой.
Специально для музея специалистами ООО «Макет» был выполнен макет Сергиевского подворья ИППО в Иерусалиме, возвращённого в российскую собственность в декабре 2008 года.
Впервые экспонируется макет храма Св. Николая Чудотворца и подворья ИППО в Бари (Италия), созданный в 1913 году по рисунку великого русского зодчего А. В. Щусева и специально доставленный из Италии к открытию музея. Макет был сделан по заказу Барградского комитета ИППО и несколько недель находился у Великой княгини Елизаветы Фёдоровны в Марфо-Мариинской обители. В коллекции музея находятся материалы заседаний Совета ИППО, заявления о вступлении в члены Общества видных учёных и церковных иерархов, программы научных конференций. Впервые представлено соглашение 1964 года о продаже правительством Н. С. Хрущева большей части недвижимостей ИППО в Палестине израильским властям.
В музей переданы подарки Императорскому Православному Палестинскому Обществу и его Председателю от руководства Государства Палестина, от армянского Патриарха Иерусалима, от государственных и общественных организаций.
В состав коллекции музея входят редкие книги, изданные в XIX и XX веках благодаря издательской деятельности ИППО, а также современные научные, периодические и художественные издания, посвященные Святой Земле, истории и деятельности Императорского Православного Палестинского Общества.